הסרט "זהות גנובה" מתרחש במקביל לאירועים שקרו בסרטי בורן הקודמים ומרחיב את העולם המורכב של סוכני ה-CIA והפרויקטים הסודיים שלהם. הפוקוס הפעם הוא על דמות חדשה בשם אארון קרוס (ג'רמי רנר), סוכן מיוחד שנכנס לתמונה בעקבות ההשלכות של הפעולות שעשה ג'ייסון בורן. קרוס הוא חלק מתוכנית סודית של ה-CIA שמטרתה ליצור סוכנים משודרגים, אך כשהתוכנית מתגלגלת ומסתבכת, הוא מוצא את עצמו במאבק קשה על חייו. לצד קרוס, מופיעים דמויות מוכרות מהסרטים הקודמים, מה שמחבר את הסיפור לעלילה הכוללת ומעמיק את ההבנה לגבי המנגנונים הפנימיים בתוך הסוכנות.
הסרט חושף את המורכבות והכוח האפל של ה-CIA, כאשר מנהלים בכירים כמו אדוארד נורטון וסקוט גלן מגלמים דמויות שמפקחות ומנווטות את התוכנית מתוך אינטרסים אישיים ומדיניים. קרוס נאלץ להתמודד לא רק עם איומים חיצוניים, אלא גם עם בגידות פנימיות ועם הצורך להגן על עצמו מפני אותם אנשים שהיו אמורים להיות שותפיו לעבודה. במקביל, הוא מנסה לחשוף את האמת מאחורי הפרויקט שבו הוא מעורב, תוך כדי שהוא מתמודד עם סכנות שמאיימות על חייו ועל עתידו. הסרט, בבימויו של טוני גילרוי שגם כתב את הסרטים הקודמים בסדרה, מציג עולם מתוחכם של ריגול, מתח ומאבק על זהות ושליטה. אארון קרוס חייב לנווט בסביבה מסוכנת שבה כל צעד יכול להיות ההבדל בין חיים למוות, כשהוא נלחם לא רק על הישרדותו אלא גם על חשיפת האמת שמאחורי הפרויקט הסודי שמאיים לשנות את כללי המשחק בעולם הריגול.
