ג'ייסון בורן (מאט דיימון) מתעורר בים התיכון עם פצעים קשים וללא זיכרון על עברו. הוא ניצל מניסיון רצח מסתורי, אך לא יודע מי הוא ומה גורם לכך שרודפים אחריו. בהדרגה, בורן מגלה שיש לו מיומנויות יוצאות דופן בלחימה ובהתגוננות, מה שמוביל אותו להבין שהוא היה חלק ממשהו מסוכן וחשאי. בחיפושיו אחר זהותו האמיתית, הוא מוצא חשבון בנק בשווייץ ומתחיל לחבר את הפאזל של חייו. במהלך המסע, בורן פוגש את מארי (פרנקה פוטנטה), שמחליטה לעזור לו לברוח מהמרדפים ולהבין את האמת. השניים נעים בין ערים אירופאיות, כשהם נרדפים על ידי רוצחים מקצועיים שמנסים להשתיק את בורן. בפריז מתרחשות מרדפי מכוניות מותחים שבהם בורן משתמש בכישורי הנהיגה והלחימה שלו כדי לשרוד. ככל שהסיפור מתקדם, מתגלה רשת מורכבת של ריגול בינלאומי, בה מעורבים סוכנים חשאיים וארגוני מודיעין.
בורן נאבק לא רק ברוצחים שמנסים להעלים אותו, אלא גם במאבק פנימי להבין מי היה ומה גורם לו להיות במרכז הסכנה. המסע שלו הוא גם מסע גילוי עצמי, שבו הוא מתמודד עם שאלות מוסריות על עברו ועל הבחירות שעשה. ככל שהוא מתקרב לאמת, מתגלה כי חייו תלויים ביכולת שלו לשבור את המעגל של רדיפה והונאה ולהחזיר לעצמו את זהותו האבודה. כל צעד שהוא עושה מקרב אותו אל האמת, אך גם מסכן את חייו ואת אלו שסביבו.
