ג'ייסון בורן (מאט דיימון) חוזר לאחר שנים של היעדרות, כשהעולם סביבו מתמודד עם תקופה של חוסר יציבות חסרת תקדים. לאחר שנים שבהן נעלם מהעין, בורן מתחיל לזכור את זהותו האמיתית, את העבר שהשתתק בו ואת הסודות שהוסתרו ממנו. הוא מוצא את עצמו שוב בתוך מערבולת של ריגול, מרדפים ומאבקים פוליטיים שמערערים את היציבות העולמית. בורן מנסה לפענח את האמת שמאחורי האירועים שמתרחשים סביבו, לחשוף את האינטרסים הנסתרים ואת הכוחות שפועלים מאחורי הקלעים. במהלך המסע, הוא מתעמת עם אויבים חדשים וישנים, ומגלה עד כמה העבר שלו קשור לעתיד הלא בטוח של העולם. לצד זאת, בורן נאלץ להתמודד עם שאלות של נאמנות, זהות ומוסר, כשהוא מנסה לשרוד ולמצוא דרך להגן על עצמו ועל אלה שקרובים אליו. הסרט מציג את מאבקו של ג'ייסון בורן לגלות את השורשים האמיתיים של הסכנות שמאיימות על יציבות העולם, כשהוא נע בין ערים שונות, רודף ומורדף, ומנסה לשבור את המעגל האפל שבו הוא נמצא. בורן, שמוגדר על ידי עברו כמרגל מיומן וכאיש פעולה חסר רחמים, מנסה לחדש את חייו ולמצוא משמעות בתוך עולם שבו האמת מוסתרת והבטחון הוא דבר נדיר. כל צעד שלו מלווה בסכנות חדשות, והוא חייב להשתמש בכל כישוריו כדי לשרוד ולהביא לאור את מה שהוסתר במשך שנים רבות. במהלך המסע שלו, בורן פוגש את ניה (אליסיה ויקנדר), מומחית טכנולוגית צעירה שמסייעת לו לנווט בין רשתות המידע המורכבות. יחד הם חושפים קונספירציה רחבה שמערבת סוכנויות ביון וממשלות, שמטרתה לשלוט במידע ולשלוט על העולם באמצעות טכנולוגיה מתקדמת. בורן מתמודד עם וינסנט קסל, סוכן מתוחכם ורצחני, שמנסה לעצור אותו בכל מחיר. הסרט מסתיים במאבק סוער שממחיש את המתח בין חופש לפרטיות, ואת המאבק המתמיד בין טוב לרע בעולם של ריגול ומניפולציות.
