ויקטור ואן דורט, צעיר מתבודד ממשפחה שאפתנית, מוצא את עצמו בקצה העיירה הוויקטוריאנית שבה הוא חי בסוף המאה ה-19. הוא מאורס לויקטוריה אברגלוט, בת למשפחה אמידה אך נקרעת כלכלית, שמבקשת להינשא לו כדי להציל את מעמדה ולהימנע מעוני. המשפחות, כל אחת עם שאיפותיה, מצפות שהקשר יבטיח יציבות חברתית וכלכלית. ויקטור מתאמן על נאום הנדרים ביער כאשר בטעות הוא מחתן את עצמו עם אמילי, כלת רפאים שנפטרה באירוע טרגי וממתינה לנישואים אמיתיים שיגרמו לה להשתחרר מעול הרוחניות. אמילי, מלאת חן ועצבות, לוקחת את ויקטור לעולם המתים, שם הוא מתמודד עם מציאות חדשה ומורכבת.
בינתיים, ויקטוריה, הממתינה לויקטור בחיים, נאבקת לשמור על אהבתם מול סכנות חיצוניות. אורח עשיר ומסתורי מגיע לעיירה ומאיים לשבש את עתידו של ויקטור ולהפריד בין האוהבים. שני הנשים, אמילי וויקטוריה, מתחרות על לבו של ויקטור, כל אחת בדרכה, כשהבחירה בין עולם החיים לעולם המתים הופכת למאבק על גורלו האמיתי. ויקטור מתמודד עם הקונפליקט בין חובותיו למשפחתו ולחברה לבין רגשותיו והאמת הפנימית שלו. סיפורו חושף את המורכבות של אהבה, נאמנות והקרבה בתוך מסגרת חברתית קשוחה ומסורתית, כשהוא נלחם לשחרר את עצמו מהכבלים של המעמד והגורל שנקבע לו מראש. בסופו של דבר, ויקטור מבין שעליו לבחור בדרך שתוביל לאושר אמיתי ולא רק לשביעות רצון חברתית. באמצעות אומץ לבו, הוא מצליח לשחרר את אמילי מעול הרפאים, ומאפשר לה למצוא מנוחה שלמה. ויקטור חוזר לעולם החיים, שם הוא מתאחד עם ויקטוריה, והם מתחילים חיים חדשים מלאים בתקווה ואהבה. הסרט משלב אלמנטים של פנטזיה, רומנטיקה ודרמה, ומשקף את המאבק בין חיים ומוות, בין חובות אישיים לבין שאיפות חברתיות. בעזרת אנימציה ייחודית ועיצוב ויקטוריאני עשיר, "חתונת הרפאים" מציג סיפור מרגש על אהבה נצחית, בחירה חופשית והתגברות על פחדים. המוזיקה של דני אלפמן תורמת לאווירה הקסומה והמרגשת, והמשחק הקולי של ג'וני דפ והלנה בונהאם-קרטר מעצים את חוויית הצפייה. הסרט הפך לקלאסיקה מודרנית באמנות האנימציה.
