האויב שבפנים: ההשמדה

שנים אחרי האסון שהחריב את רייקון סיטי, אליס (מילה יובוביץ') נאבקת לשרוד בעולם הרוס ונטוש שבו נגיף ה-T הרס כמעט את כל האנושות והפך רבים לזומבים רעבים. אליס חשה לעיתים שהיא נטל על שאר הניצולים, אך היא נחושה להביא לסיום את שלטון חברת אמברלה, האחראית להפצת הנגיף ולהרס. אלברט וסקר, מנהיג אמברלה, ממשיך לפקח על ניסויים ומחקרים שמבוצעים על ידי ד"ר אייזק, במטרה להמשיך ולפתח את הנגיף ולשלוט בעולם החדש שנוצר.

במקביל, קבוצת ניצולים הכוללת את קרלוס אוליביירה, אל.ג'יי, קלייר רדפילד וחברים נוספים כמו קיי-מרט, חוצים את מדבר נבדה במאמץ להגיע להריסות לאס וגאס, שם הם מקווים למצוא מקלט וביטחון. המסע שלהם מלא סכנות, כשצבא זומבים שנוצרו על ידי נגיף ה-T מתנפל עליהם ללא הפסקה. הניצולים חייבים להיאבק לא רק בזומבים אלא גם במזימות של אמברלה שמנסה לשלוט על כל מה שנותר מהעולם. המאבק של אליס ושל הניצולים הוא לא רק על הישרדות יומיומית, אלא גם על תקווה לעתיד שבו האנושות תוכל להתגבר על האפלה שנפלה עליה. הם מתמודדים עם האימה והכאב של עולם שנחרב, עם האויבים שמאיימים מכל עבר, ועם השאלה האם ניתן לעצור את אמברלה ולהחזיר את העולם למסלול שבו בני אדם יוכלו לחיות שוב בביטחון. כל צעד במסע הזה הוא קריטי, כי כל טעות עלולה להיות האחרונה.