ניאו (קיאנו ריבס) עומד בפני הקרב האחרון במאבק האפי בין בני האדם למכונות, כשהגורל של העיר ציון ושל האנושות תלוי במאבק הזה. ציון, העיר האחרונה של בני האדם, מתגברת את צבאה בעזרת אזרחים אמיצים שמצטרפים למאבק נגד השולטים המכנית. המלחמה מתנהלת נגד סנטינלים – מכונות משמידות שמאיימות לחדור אל מעוזם האחרון ולהשמיד את כל מה שנותר. התושבים נלחמים לא רק על חייהם, אלא גם על עתיד האנושות כולה, כשהם מתמודדים עם מתקפה חסרת רחמים שמאיימת למחוק את כל התקווה שנותרה. במקביל, ניאו ממשיך במסעו האישי, מנסה למצוא דרך להביא שלום בין שני הצדדים ולמנוע השמדת העולם האנושי. הסרט, שהוא הפרק הסופי בטרילוגיית מטריקס, מציג את המאבק המורכב בין חופש לשרירותיות, בין יצירה להשמדה, ואת ההקרבה האישית של כל דמות במאבק על הישרדות. הצופים נחשפים לקרבות עוצרי נשימה, רגעים דרמטיים של תקווה וייאוש, ולמסע של גיבור שמנסה להוביל את בני האדם לניצחון או לפחות להישרדות. כל דקה במטריקס רבולושנס טומנת בחובה את המתח וההכרעה הסופית, כשהשאלה המרכזית היא האם ניאו והאנושות יצליחו לנצח את המכונות ולהבטיח את המשך קיומם. בסופו של דבר, ניאו מגיע להסכם עם המכונות, כשהוא מציע להילחם לצדן נגד האיום המשותף של סמית', וירוס מסוכן שמאיים להשמיד את שני העולמות. הקרב הסופי בין ניאו לסמית' הוא דרמטי וקובע את גורל המטריקס והאנושות. בעקבות הקרב, ניאו מקריב את עצמו כדי להביא שלום זמני, והמכונות מסכימות להפסיק את המלחמה ולכבד את חופש הבחירה של בני האדם. הסרט מסתיים בסצנה שמציגה תקווה חדשה לעתיד, עם ציון שנבנית מחדש ועם הבטחה שהמאבק על החופש יימשך בדרכים חדשות. מטריקס רבולושנס מסכם את הטרילוגיה עם מסר על האיזון בין טכנולוגיה לאנושיות, ועל הכוח של בחירה אישית ומשמעותה בעולם משתנה ותובעני.
