ברוס ויין (ואל קילמר), המיליארדר המסתורי שמסתיר את זהותו כבאטמן, מוצא את עצמו מול איומים חדשים ומסוכנים על גות'האם סיטי. שני הנבלים המרכזיים, טו-פייס (טומי לי ג'ונס) ורידלר (ג'ים קארי), מתכננים יחד להפוך את העיר לזירת פשע בלתי נשלטת. טו-פייס, עם הפנים המחולקות שלו, שואף לנקום על העוולות שנעשו לו בעבר, בעוד רידלר משתמש בחידות מורכבות ובמכשולים מנטליים כדי לבלבל ולהשיג שליטה. במקביל, דמות חדשה נכנסת למשחק: רובין (כריס או'דונל), נער צעיר שמאבד את משפחתו בעקבות מעשי טו-פייס, ומחליט להצטרף לבאטמן במאבק נגד הפושעים מתוך רצון לנקום ולהגן על העיר. הקשר בין באטמן לרובין מתפתח, והם יוצרים צוות שמנסה להביא סדר לצדק.
ד"ר צ'ייס מרידיאן (ניקול קידמן), פסיכולוגית מצליחה ויפהפייה, מתקרבת לברוס ויין בניסיון לפתות אותו ולגלות את סודו. מערכת היחסים ביניהם מורכבת ומלאת מתחים, כאשר ד"ר מרידיאן מנסה לשבור את החומות שבאטמן בנה סביבו ולהבין את האיש שמאחורי המסכה. הסרט מתמקד במאבק הפנימי והחיצוני של ברוס ויין, שבין הרצון לנקום, לשמור על צדק ולשמור על זהותו הסודית. ככל שהאיומים גוברים, גם הקשרים האישיים והרגשיים שלו מתערערים. באטמן ורובין חייבים ללמוד לעבוד יחד, ולהתגבר על הפחדים והכאב שלהם, כדי לעצור את טו-פייס ורידלר לפני שהעיר כולה תיפול לידיהם. המאבק על גורל גות'האם מגיע לשיא דרמטי, כשהעתיד של העיר ושל הגיבורים תלוי בהחלטותיהם.
