ר.ג'יי, דביבון מתוחכם וסקרן, מגיע ליער חדש ומגלה קהילה של חיות בר שחיות בפחד מתמיד מפני בני אדם. הקבוצה, בראשותו של צב בשם וורן, מתמודדת עם האיום המתמשך שמגיע מהאנשים, במיוחד אחרי אירוע מפחיד שבו וורן נחשף לילדים אנושיים מאיימים. ר.ג'יי, שמכיר עולם שונה ומודרני יותר, חושף את החיות לעולם חדש שבו בני האדם משאירים מאכלים בשפע בתוך מכולות גדולות, ומראה להם כיצד ניתן לנצל את זה לטובתם. בהדרגה, החיות מתחילות להרגיש יותר בטוחות ונינוחות בסביבת האדם, לומדות כיצד לגשת למזון ולחיות לצד בני האדם מבלי להיפגע. אך עם כל ההתקדמות הזו, עולה גם החשש מפני אובדן הביטחון ביער שלהם, והתחושה שהשטח הבטוח שלהם הולך ומצטמצם. ר.ג'יי והחיות חייבים למצוא דרך לשלב בין העולם הטבעי שלהם לבין המציאות המשתנה, תוך כדי התמודדות עם האתגרים והסכנות שמביא עמו המפגש עם בני האדם. המתח בין הרצון להישאר בטוחים לבין הצורך לנצל את ההזדמנויות החדשות מוביל אותם להרפתקה מלאה בקונפליקטים, חוויות משעשעות ורגעים של חברות אמיצה. כל אחד מהדמויות, בראשות וורן הרגזן ור.ג'יי השנון, לומד להעריך את החשיבות של שיתוף פעולה ולקיחת סיכונים כדי לשמור על הקהילה שלהם ועל היער שהם קוראים לו בית. בסופו של דבר, החיות מבינות שהן לא יכולות להישאר מבודדות מהעולם האנושי, אך גם לא לוותר על ערכי הטבע והביטחון שלהן. ר.ג'יי, וורן ושאר החברים מוצאים דרכים יצירתיות לשמור על איזון בין השניים, כשהם משתמשים בתושייה ובחכמה כדי להגן על היער ולחיות בהרמוניה עם הסביבה החדשה. הסרט מדגיש את החשיבות של קבלת השונה, שיתוף פעולה בין יצורים שונים והיכולת להסתגל לשינויים מבלי לאבד את העצמאות והזהות. באמצעות הומור והרפתקאות, "מעבר ליער" מציג מסר אקולוגי וחברתי על שמירה על הטבע לצד קבלת טכנולוגיה וחדשנות. בסופו של דבר, החיות מגלות שכוחן טמון באחדות וביכולת להתמודד עם האתגרים החדשים יחד.
