גרהם הס (מל גיבסון) הוא כומר שמנסה להתמודד עם משבר אישי עמוק לאחר מותו הטראגי של אשתו. חייו משתנים כשמסתמן ממצא מוזר בשדה התירס של משפחתו – מעגל ענק ומסתורי שנוצר בלילה, ללא הסבר ברור. התופעה המוזרה מעוררת היסטריה תקשורתית רחבה, והספקולציות לגבי נוכחות חייזרים מקבלות גושפנקא ציבורית. גרהם ומשפחתו, הכוללת את ילדיו מרסי (אביגייל ברסלין) ומורגן (רורי קלקין), מוצאים עצמם במרכז סערה לא רק חיצונית אלא גם פנימית. הם נאלצים להתמודד עם שאלות קיומיות על אמונה, אובדן ותקווה, כשכל אחד מהם מתמודד עם הפחדים והספקות שלו. במהלך האירועים, גרהם נאלץ לשוב ולהתמודד עם אמונתו הכמורה, שנראית כמתערערת לנוכח המסתורין שמקיף את מעגל התירס והאיומים הלא מובנים שמגיעים בעקבותיו. המשפחה מתמודדת עם תחושת אי-וודאות גוברת, כשהם מנסים לפענח את משמעות התופעה ולמצוא דרך לשמור על אחדותם בתוך סערת האיום הבלתי צפוי. במאבקם לחשוף את האמת ולהגן על יקיריהם, הם מתמודדים עם פחדים עמוקים ועם שאלות על גורל, אמונה והקשר בין עולם הרוח לעולם הממשי. הסרט מתמקד בפן האנושי של המשפחה ובאופן שבו האמונה והאהבה יכולים להוות מגן מפני האימה והבלתי נודע, כשהם נלחמים לשמור על תקווה בתוך סערת אירועים שמעוררת תהיות על קיומם של חיים מחוץ לכדור הארץ. בהמשך הסרט, התגליות המפתיעות והמפגשים המסתוריים עם היצורים הלא-ידועים מובילים את גרהם ומשפחתו לפריצת דרך רגשית משמעותית. הם לומדים להעריך מחדש את הקשר ביניהם ואת כוח האמונה, שמעניק להם את האומץ להתמודד עם האתגרים. הסרט מדגיש את חשיבות המשפחה והחיבור האנושי כשמוליכים אותם אל מעבר לפחדים ולספקות. בסופו של דבר, "סיינס" מציג מסר מעורר השראה על היכולת למצוא משמעות ותקווה גם בזמנים הקשים ביותר, כשהאדם ניצב מול הלא נודע ומנסה למצוא את מקומו בעולם.
