ארבע שנים אחרי קריסת פארק היורה החדש, אי נובלה שבו שוכן עולם היורה עומד בפני סכנה חמורה: התפרצות געש צפויה להשמיד את כל החיים עליו. דינוזאורים, ששרדו את כל הסכנות הקודמות, נמצאים כעת בסכנת הכחדה ממשית. צוות המחקר המקורי, הכולל את אוון (כריס פראט) וקלייר (ברייס דאלאס הווארד), נקרא לחזור לאי במטרה להציל את היצורים המדהימים האלה. המשימה שלהם היא מורכבת ומסוכנת – לא רק שעליהם להתמודד עם האי עצמו וההתפרצות הקרבה, אלא גם עם כוחות נסתרים שמנסים לנצל את הדינוזאורים למטרות אישיות ועסקיות.
המטרה המרכזית של הצוות היא להציל את "בלו", הדינוזאורית החכמה והמסורה שהפכה לסמל של עולם היורה. במהלך הפעילות, הם מגלים כי יש מי שמבקש להבריח את הדינוזאורים מהאי כדי להפוך אותם לכלי נשק ביולוגיים, מה שמעמיד את כל האנושות בסכנה. אוון וקלייר נאבקים לא רק על חיי הדינוזאורים אלא גם על עתידם של בני האדם, כשהם מתמודדים עם בגידות, הפתעות מסוכנות ויצורים פראיים שמשתחררים מכל שליטה. הסרט מתמקד במאבק בין הרצון לשמר את הטבע המופלא והעתיק לבין ניצולו לצרכים אנוכיים. כל רגע הוא קריטי, וכל החלטה יכולה להוביל להישרדות או להשמדה מוחלטת. בעולם שבו הטכנולוגיה והטבע מתנגשים, אוון וקלייר חייבים למצוא דרך להגן על הדינוזאורים ולמנוע אסון עולמי שיכול לשנות את פני ההיסטוריה. הצוות מגלה שהאי אינו רק אתר טבעי אלא גם מרכז ניסויים סודיים, בהם מנסים לשכפל ולשנות את הדינוזאורים לצורכי נשק. תוך כדי המאבק להצלת בלו ושאר היצורים, הם נאלצים להתמודד עם כוחות צבאיים ומדענים מושחתים. בסופו של דבר, הם מצליחים להבריח כמה דינוזאורים לעולם החופשי, אך השאלה האם האנושות מוכנה להתמודד עם ההשלכות נשארת פתוחה ומאיימת.
